Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clcn6O35454 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn6O35454 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Clcn6O35454 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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