Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms