Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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