Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr1aO35134 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms