Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ArxO35085 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ArxO35085 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ArxO35085 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ArxO35085 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ArxO35085 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ArxO35085 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ArxO35085 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ArxO35085 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms