Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms