Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms