Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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