Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms