Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3415J3QMS8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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