Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm11236J3QMS7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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