Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21818J3KMS6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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