Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms