Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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