Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms