Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5160F8VPN3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms