Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdh9F8VPK8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms