Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M1F7CXU4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms