Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3371F7CQW8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3371F7CQW8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms