Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms