Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngap1F6SEU4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms