Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm340F6RGI3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm340F6RGI3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm340F6RGI3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm340F6RGI3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm340F6RGI3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms