Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc7bE9Q9Y3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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