Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms