Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r238E9Q373 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r238E9Q373 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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