Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3250E9Q1M3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3250E9Q1M3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms