Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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