Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms