Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms