Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms