Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc8E9PWG2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms