Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf217D3YYI7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf217D3YYI7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf217D3YYI7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf217D3YYI7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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