Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim30cD3YVI9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30cD3YVI9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms