Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5483B2RV77 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms