Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan5bB2RTN3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms