Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apol7aB2RT54 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms