Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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