Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms