Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nfx1B1AY10 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nfx1B1AY10 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms