Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms