Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem238A9JSM3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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