Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm11127A7VMS2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm11127A7VMS2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm11127A7VMS2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm11127A7VMS2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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