Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms