Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Patl2A2ARM1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms