Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtf1A2AQ19 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms