Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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