Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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