Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn6A2AJB9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms