Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms