Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms